2004年5月，山东航空学院黄河三角洲生态环境研究中心成立。2007年3月，山东省科学技术厅、山东省财政厅批准山东航空学院建设“山东省黄河三角洲生态环境重点实验室”。2011年8月，实验室通过山东省科学技术厅的建设评估验收。

　　实验室现有研究人员36人。其中，教授10人，副教授15人；博士31人。2人为博士生导师，6人为硕士生导师。黄河三角洲生态环境研究团队被评为滨州市首批五个优秀创新团队之一，并记滨州市集体二等功；生态学学科为山东省重点学科；生态学本科专业为山东省特色专业。目前，实验室面积2150平方米；仪器设备总值2000余万元，其中，进口仪器设备总值1200余万元。建有样品前处理、化学分析检测、微生物分析、植物生理生态、水-土壤环境修复等实验平台。实验室先后被评为山东省“三星级”科普基地和“全国科普教育基地”。

　　实验室立足山东省及黄河三角洲经济、社会发展中的生态环境问题，在生物地球化学与全球变化，盐碱地植被恢复与重建，污染生态与修复，生态系统服务功能与评价等方面开展创新性应用基础研究和应用技术开发研究。实验室与中国环境科学研究院、中国科学院烟台海岸带研究所、中国科学院东北地理与农业生态研究所、北京师范大学、中国矿业大学（北京）等省内外单位建立了稳定的合作关系。

　　近五年来，实验室共承担国家级课题20项，省部级课题45项，获得科研经费2000余万元。获得省部级二等奖5项，三等奖7项。出版学术著作5部，教材4部；获得授权国家发明专利19项；发表学术论文200余篇，其中SCI/EI论文100余篇。