2004年以，黄河三角洲生态环境研究中心获教育部高等学校科学技术进步二等奖1项，海洋创新成果二等奖1项，山东省科技进步二等奖1项、三等奖3项，市厅级奖励30余项。
黄河三角洲生态环境研究中心部分获奖成果
| 序号 | 奖励时间 | 成果名称 | 成果类型 | 获奖等级 | 获奖人 |
| 1 | 2010 | 黄河三角洲地区米草的生态调查 与防治关键技术研究 | 山东省科技进步奖 | 二等奖 | 田家怡 |
| 2 | 2009 | 互花米草的生态控制 与综合利用研究 | 教育部高校科研优秀成果奖 （科学技术）科技进步奖 | 二等奖 | 田家怡 |
| 3 | 2007 | 山东省生态安全问题与 生态安全能力建设对策研究 | 山东省科技进步奖 | 三等奖 | 田家怡 |
| 4 | 2009 | 南水北调东线工程山东段生态 安全问题研究及预警控制对策 | 山东省科技进步奖 | 三等奖 | 田家怡 |
| 5 | 2009 | 南水北调东线工程山东段生态 安全问题研究及预警控制对策 | 山东省社会科学优秀成果奖 | 二等奖 | 田家怡 |
| 6 | 2009 | 新建地方本科院校教学质量 管理体系研究与实践 | 山东省高等教育教学成果奖 | 二等奖 | 李长海 |
| 7 | 2009 | 区域应用本科院校实践教学体系 构建研究及实施——以滨州学院为例 | 山东省高等教育教学成果奖 | 三等奖 | 李长海 |
| 8 | 2010 | 黄河三角洲生态环境灾害与减灾对策 | 山东省社会科学优秀成果奖 | 三等奖 | 田家怡 |